关于28377频率采样精度的问题

用的技术书里的例程，采样信号发生器的PWM波能采准，但是采样驱动信号时，频率不准且会有毛刺，如何在算法上解决呢？

//采样频率取值
    T1=ECap1Regs.CAP2;
    T2=ECap1Regs.CAP3;
    T3=ECap1Regs.CAP4;
    T4=ECap1Regs.CAP1;
    fs1=200000000/T1;//此处应该还需要对数据进行转换才能表达真实频率
    fs2=200000000/T2;
    fs3=200000000/T3;
    fs4=200000000/T4;
    fsavg[resultsIndex]=(fs1+fs2+fs3+fs4)/4;